More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4278 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  76.41 
 
 
396 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0470  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00495731  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  76.96 
 
 
397 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  76.96 
 
 
397 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  83.29 
 
 
397 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0440  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580271  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0452  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536518  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  77.4 
 
 
396 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  77.4 
 
 
396 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  75.37 
 
 
396 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  77.15 
 
 
396 aa  650    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0482  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448228  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  76.41 
 
 
396 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0624  translation elongation factor Tu  81.28 
 
 
397 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000430921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  78.38 
 
 
396 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  76.41 
 
 
396 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0355  elongation factor Tu  78.13 
 
 
396 aa  634    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0367  elongation factor Tu  78.13 
 
 
396 aa  634    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  81.28 
 
 
397 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  79.8 
 
 
394 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0485  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000994987  normal  0.0792856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  76.9 
 
 
396 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  76.96 
 
 
397 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  77.34 
 
 
396 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75.92 
 
 
396 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75.92 
 
 
396 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5081  elongation factor Tu  81.57 
 
 
397 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406478  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5093  elongation factor Tu  81.57 
 
 
397 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000584025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  76.6 
 
 
396 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0717  elongation factor Tu  83.33 
 
 
398 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000389336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  77.09 
 
 
396 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  74.2 
 
 
396 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  74.2 
 
 
396 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  77.34 
 
 
396 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  75.06 
 
 
402 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  77.4 
 
 
396 aa  652    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  87.93 
 
 
407 aa  750    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  87.93 
 
 
407 aa  750    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  75.68 
 
 
396 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  75.92 
 
 
396 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  76.35 
 
 
396 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  76.35 
 
 
396 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  76.41 
 
 
396 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  76.41 
 
 
396 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  78.38 
 
 
396 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  78.57 
 
 
394 aa  634    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0419  elongation factor Tu  80.84 
 
 
397 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00911087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4763  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000500279  normal  0.983008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4751  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000118941  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  76.9 
 
 
396 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.17 
 
 
396 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  78.82 
 
 
394 aa  634    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  unclonable  0.0000000372179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  83.05 
 
 
400 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  100 
 
 
407 aa  829    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289642  unclonable  0.00000000000640465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  78.82 
 
 
394 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  78.57 
 
 
394 aa  634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  78.82 
 
 
394 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  78.82 
 
 
394 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0473  elongation factor Tu  81.33 
 
 
397 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00354481  normal  0.0345363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  76.96 
 
 
397 aa  641    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  83.05 
 
 
397 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  83.29 
 
 
397 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  76.6 
 
 
396 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  83.05 
 
 
397 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  83.05 
 
 
397 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  76.66 
 
 
396 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  83.54 
 
 
397 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  83.54 
 
 
397 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  78.57 
 
 
394 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>