More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0931 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  79.56 
 
 		 394 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  76.41 
 
 		 397 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  78.13 
 
 		 394 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0440  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 397 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580271  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0452  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 397 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536518  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  78.87 
 
 		 394 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000313949  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  79.36 
 
 		 394 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  79.61 
 
 		 394 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0624  translation elongation factor Tu  83.05 
 
 		 397 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000430921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0380  elongation factor Tu  78.08 
 
 		 396 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0392  elongation factor Tu  78.08 
 
 		 396 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0355  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0367  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  83.29 
 
 		 397 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  84.24 
 
 		 397 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0473  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 397 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00354481  normal  0.0345363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  78.08 
 
 		 396 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  78.38 
 
 		 394 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  78.33 
 
 		 396 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5081  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 397 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406478  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5093  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 397 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000584025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  78.38 
 
 		 394 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  84.24 
 
 		 397 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0190  elongation factor Tu  78.13 
 
 		 394 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000235247  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0717  elongation factor Tu  85.75 
 
 		 398 aa  697    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000389336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  79.12 
 
 		 394 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  76.66 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  100 
 
 		 407 aa  830    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  100 
 
 		 407 aa  830    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 396 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  76.66 
 
 		 396 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  76.66 
 
 		 396 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  76.11 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  76.11 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  87.93 
 
 		 407 aa  750    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289642  unclonable  0.00000000000640465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0419  elongation factor Tu  82.02 
 
 		 397 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 396 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 394 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0603  elongation factor Tu  77.89 
 
 		 394 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3996  elongation factor Tu  77.89 
 
 		 394 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000528557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 397 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 400 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  79.85 
 
 		 394 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  79.85 
 
 		 394 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  79.85 
 
 		 394 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 394 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0444  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 396 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0557163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0456  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 396 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  76.41 
 
 		 397 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0485  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 397 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000994987  normal  0.0792856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  79.36 
 
 		 394 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000023337  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 397 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 397 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  77.09 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  77.89 
 
 		 394 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276369  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  79.61 
 
 		 394 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  79.61 
 
 		 394 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3756  elongation factor Tu  78.13 
 
 		 394 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000175435  decreased coverage  0.00120864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.6 
 
 		 396 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>