More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0485 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0473  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00354481  normal  0.0345363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0440  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580271  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0452  elongation factor Tu  99.24 
 
 		 397 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536518  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  91.69 
 
 		 397 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 396 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0624  translation elongation factor Tu  94.44 
 
 		 397 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000430921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0380  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0392  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0355  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0367  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  95.45 
 
 		 397 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5081  elongation factor Tu  98.74 
 
 		 397 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406478  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5093  elongation factor Tu  98.74 
 
 		 397 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000584025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 407 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  83.74 
 
 		 407 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0470  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00495731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  81.33 
 
 		 407 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289642  unclonable  0.00000000000640465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 396 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0482  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0419  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00911087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0485  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000994987  normal  0.0792856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  79.85 
 
 		 396 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  87.91 
 
 		 397 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  87.91 
 
 		 400 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  78.79 
 
 		 394 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  78.79 
 
 		 394 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  76.18 
 
 		 402 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4763  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000500279  normal  0.983008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4751  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000118941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  87.91 
 
 		 397 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  87.91 
 
 		 397 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0717  elongation factor Tu  87.69 
 
 		 398 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000389336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 394 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 394 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  91.69 
 
 		 397 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000026192  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>