60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1849 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  68.67 
 
 
405 aa  558  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  69.63 
 
 
411 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  66.91 
 
 
420 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  67.91 
 
 
412 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  68.16 
 
 
412 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  67.74 
 
 
412 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  67.16 
 
 
405 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  68.67 
 
 
405 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  69.29 
 
 
413 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  67 
 
 
416 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  66.83 
 
 
418 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  67.07 
 
 
422 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  67.32 
 
 
422 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  67.74 
 
 
404 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  67.32 
 
 
422 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  66.67 
 
 
420 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  67.16 
 
 
420 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  69.04 
 
 
410 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  65.59 
 
 
403 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  66.99 
 
 
422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  69.17 
 
 
408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  65.08 
 
 
408 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  66.42 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  67.32 
 
 
422 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  67.68 
 
 
403 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  67.65 
 
 
410 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  66.75 
 
 
414 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  61.86 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  58.25 
 
 
403 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  56.96 
 
 
411 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  60.89 
 
 
406 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  58.08 
 
 
411 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  54.05 
 
 
432 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  52.94 
 
 
432 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  57.84 
 
 
409 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  53.92 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  53.68 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
400 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 
420 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  52.7 
 
 
418 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  52.63 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  53.3 
 
 
419 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  52.4 
 
 
419 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  52.83 
 
 
416 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  52.76 
 
 
415 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  52.31 
 
 
419 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 
433 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  46.4 
 
 
428 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  48.6 
 
 
419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  46.12 
 
 
424 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 
443 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  45.98 
 
 
409 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  47.06 
 
 
441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  47.44 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  37.14 
 
 
454 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  26.47 
 
 
604 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>