57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_11061 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  100 
 
 
415 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  76.89 
 
 
420 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  76.4 
 
 
420 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  75.18 
 
 
416 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  68.92 
 
 
419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  68.67 
 
 
419 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  56.48 
 
 
419 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  55.83 
 
 
418 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
420 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  56.28 
 
 
405 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  54.81 
 
 
412 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  54.01 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  55.29 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  55.05 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  52.93 
 
 
418 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  53.02 
 
 
419 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 
411 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  53.48 
 
 
408 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  54.31 
 
 
403 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 
409 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  55.04 
 
 
416 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  51.82 
 
 
408 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  53.4 
 
 
413 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  52.87 
 
 
432 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  51.91 
 
 
432 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  51.57 
 
 
420 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  50.86 
 
 
398 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  52.81 
 
 
405 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  53.04 
 
 
420 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  52.91 
 
 
403 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  54.55 
 
 
402 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  52.2 
 
 
404 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  53.04 
 
 
420 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  52.98 
 
 
411 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  56.2 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  54.93 
 
 
403 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  52.57 
 
 
405 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  53.46 
 
 
414 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  52.54 
 
 
422 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  55.21 
 
 
410 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  52.3 
 
 
422 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  52.3 
 
 
422 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  52.3 
 
 
422 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  52.54 
 
 
422 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  50.88 
 
 
400 aa  356  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  53.25 
 
 
410 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  49.27 
 
 
433 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  52.12 
 
 
406 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  47.42 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  44.99 
 
 
424 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 
422 aa  315  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  46.44 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  47.79 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  46.52 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  44 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  38.44 
 
 
454 aa  263  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>