57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4212 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  94.63 
 
 
441 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  100 
 
 
412 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  71.26 
 
 
422 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  69.78 
 
 
424 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  47.82 
 
 
419 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  49.12 
 
 
418 aa  342  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  52.28 
 
 
412 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  52.28 
 
 
412 aa  339  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 
420 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  51.27 
 
 
412 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  51.92 
 
 
398 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  51.34 
 
 
428 aa  332  9e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  49.62 
 
 
405 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 
411 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  49.36 
 
 
416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  50.9 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  50 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  49.87 
 
 
420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  49.18 
 
 
432 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  46.17 
 
 
420 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  47.26 
 
 
420 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  49.87 
 
 
405 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  48.98 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  48.47 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  48.23 
 
 
404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 
409 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
400 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  50.13 
 
 
411 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  47.44 
 
 
408 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  46.01 
 
 
419 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  45.77 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  49.35 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  47.74 
 
 
411 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  50.62 
 
 
414 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  47.19 
 
 
418 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
443 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  49.01 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  50.25 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  50.86 
 
 
419 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  50 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  50.37 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  50.37 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
422 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  45.31 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  50.25 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  52.28 
 
 
408 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  50.25 
 
 
422 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  43.96 
 
 
408 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  49.1 
 
 
406 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  45.54 
 
 
416 aa  299  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  49.1 
 
 
403 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  51.52 
 
 
410 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  50.88 
 
 
410 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  49.5 
 
 
409 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  47.74 
 
 
402 aa  289  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  38.73 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>