58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30287 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
454 aa  922    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
420 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  40.05 
 
 
419 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  42.79 
 
 
398 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  39.9 
 
 
418 aa  286  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  42.01 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  40.05 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  39.42 
 
 
420 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  39.08 
 
 
411 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.42 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  41.06 
 
 
412 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  37.93 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  37.35 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  40.55 
 
 
412 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  37.88 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  35.84 
 
 
418 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
411 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  38.69 
 
 
416 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  40.55 
 
 
412 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  38.14 
 
 
408 aa  262  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  37.93 
 
 
405 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  40.24 
 
 
403 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  38.33 
 
 
413 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  38.44 
 
 
415 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  37.14 
 
 
408 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.41 
 
 
419 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.16 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  37.24 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  37.76 
 
 
422 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  37.76 
 
 
422 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  35.95 
 
 
404 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  38.74 
 
 
403 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  39.33 
 
 
432 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  38.28 
 
 
422 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
422 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  38.8 
 
 
416 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  36.17 
 
 
420 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  36.02 
 
 
420 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  38.67 
 
 
410 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 
409 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  39.36 
 
 
408 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  36.53 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  36.64 
 
 
402 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  35.83 
 
 
403 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
443 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  36.98 
 
 
414 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
400 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 
433 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  36.34 
 
 
410 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  37.27 
 
 
428 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  35.62 
 
 
406 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  36.43 
 
 
419 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  36.98 
 
 
409 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  36.74 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  36.74 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  37.22 
 
 
412 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  29.66 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>