58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1643 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  70.05 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  67.83 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  66.91 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  50.99 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  51.61 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  48.56 
 
 		 420 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  48.8 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  49.26 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 405 aa  358  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  50.38 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  49.62 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  48.97 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.06 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.3 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  50 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 409 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 408 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  49.37 
 
 		 416 aa  339  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  47.79 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 422 aa  335  7.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  49.63 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  48.41 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.58 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  47.93 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 422 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  47.17 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  48.61 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  47.65 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  52.06 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  50.5 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  38.11 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>