58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1851 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
443 aa  860    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  77.94 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  71.6 
 
 
419 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  66.91 
 
 
409 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  50.49 
 
 
418 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  49.76 
 
 
419 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.43 
 
 
419 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.43 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 
420 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  47.92 
 
 
420 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.68 
 
 
420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  49.02 
 
 
404 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  47.67 
 
 
405 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  50.12 
 
 
411 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  50 
 
 
419 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  49.28 
 
 
432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  49.15 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  48.77 
 
 
412 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  45.22 
 
 
408 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  48.06 
 
 
405 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  46.06 
 
 
418 aa  329  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  48.17 
 
 
412 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  47.43 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  46.8 
 
 
416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  52.07 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  47.22 
 
 
415 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
400 aa  326  5e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  47.79 
 
 
412 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
409 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  48.19 
 
 
420 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  47.8 
 
 
413 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  45.45 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  46.73 
 
 
420 aa  319  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  47.47 
 
 
420 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
422 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  47.7 
 
 
416 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  45.06 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  50.12 
 
 
408 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  45.27 
 
 
403 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  47.29 
 
 
406 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  47.93 
 
 
403 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  49.16 
 
 
422 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  47.41 
 
 
411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  46.49 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  48.07 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  48.07 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  49.03 
 
 
410 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  47.83 
 
 
422 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  49.13 
 
 
403 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
433 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  46.08 
 
 
414 aa  300  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  49.18 
 
 
441 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 
422 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  49.39 
 
 
412 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  45.06 
 
 
410 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  40.26 
 
 
454 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00370  polyamine transporter, putative  25.1 
 
 
524 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>