185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2838 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2838  thioesterase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2882  thioesterase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178637  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2869  thioesterase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  47.86 
 
 
247 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12943  thioesterase tesA  46.78 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3397  thioesterase  44.44 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.075668  normal  0.267418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.22 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  36.32 
 
 
249 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  35.19 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.61 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  33.63 
 
 
258 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.47 
 
 
256 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  36 
 
 
249 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.04 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30 
 
 
256 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4323  Thioesterase  35.45 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  33.48 
 
 
247 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.7 
 
 
1337 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  34.22 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  32.44 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.39 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  31.17 
 
 
1414 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.8 
 
 
251 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.63 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.76 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  33.05 
 
 
261 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  31.58 
 
 
271 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  33.18 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  31.56 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  32 
 
 
257 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.26 
 
 
251 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  27.76 
 
 
252 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.26 
 
 
251 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.38 
 
 
239 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  33.64 
 
 
829 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  31.11 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  31.11 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  27.59 
 
 
278 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  33.33 
 
 
269 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  31.34 
 
 
267 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  27.43 
 
 
240 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3848  thioesterase  32.46 
 
 
247 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335198  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.41 
 
 
261 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  30.74 
 
 
236 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.8 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  28.7 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.55 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.51 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  27.27 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  29.25 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  30.74 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  31.17 
 
 
832 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  26.75 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  31.34 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  27.88 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  32.08 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  29.44 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  29.96 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  29.44 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.2 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  29.96 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  29.96 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  25.55 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  23.38 
 
 
250 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  25.64 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  28.07 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  31.42 
 
 
436 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.16 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.3 
 
 
267 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  29.29 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  25.44 
 
 
242 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.06 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  30.13 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  29.96 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  31.93 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  31 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  31.93 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  31.93 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  29.71 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  30.67 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  30.43 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  31.28 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  30.19 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  28.7 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  31.51 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3469  thioesterase  32.11 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3532  thioesterase  32.11 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2693  thioesterase  31.7 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.326977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  27.68 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4555  thioesterase  30.42 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308008  normal  0.0177452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3480  thioesterase  32.11 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.128002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.57 
 
 
291 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  30.83 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  27.8 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  29.2 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  29.49 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  25.68 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  31.6 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  29.54 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  30.77 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>