35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0546 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0546  16S rRNA processing protein RimM, putative  100 
 
 		 164 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl541  16S rRNA processing protein  40.61 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000678449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  23.95 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  27.65 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  21.69 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  35.71 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  22.62 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  28.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0104  16S rRNA processing protein RimM  28.48 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  27.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  18.75 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  18.56 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  23.21 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  24.55 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04645  16S rRNA processing protein  27.27 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  25.6 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  34.15 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  18.39 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  18.39 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  24.55 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0848  16S rRNA processing protein RimM  25.3 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1397  16S rRNA processing protein RimM  20.75 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000193621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  20 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  20 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  26.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  20.23 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  18.18 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  18.18 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  18.18 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 172 aa  42  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  18.18 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  18.18 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  23.12 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>