191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1874 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60.65 
 
 
160 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.25 
 
 
173 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.71 
 
 
159 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.49 
 
 
172 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.12 
 
 
160 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.12 
 
 
160 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.84 
 
 
159 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.96 
 
 
174 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.25 
 
 
179 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  54.49 
 
 
161 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.06 
 
 
160 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.97 
 
 
177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.77 
 
 
180 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  51.85 
 
 
173 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.41 
 
 
176 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.83 
 
 
162 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  49.04 
 
 
162 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  49.68 
 
 
162 aa  164  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  53.8 
 
 
164 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.65 
 
 
171 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.84 
 
 
166 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.07 
 
 
173 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.88 
 
 
184 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.88 
 
 
184 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.68 
 
 
178 aa  148  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.95 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.45 
 
 
220 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.05 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.4 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  38.05 
 
 
269 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.38 
 
 
156 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.54 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.77 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.86 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.48 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.11 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.85 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.68 
 
 
463 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.84 
 
 
349 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.87 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.98 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.1 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.1 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.16 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.75 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.64 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.1 
 
 
344 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.49 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  29.41 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.08 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
199 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5602  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.1 
 
 
215 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31169  normal  0.82128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.73 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
225 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  39.36 
 
 
231 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.08 
 
 
258 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
225 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.73 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.97 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3529  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70668  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  53.66 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.73 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.1 
 
 
190 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.08 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
342 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2647  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.76 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  0.288591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  29.03 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2873  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.76 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716515  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.54 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2770  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.76 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36007  normal  0.0902261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.48 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.98 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
187 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  44.64 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2558  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.852048  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.14 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436029  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.94 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.98 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.9 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2781  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.08 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.06 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.1 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.78 
 
 
345 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  44.64 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  52.08 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.66 
 
 
195 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
197 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  29.03 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.337547  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1371  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.46 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.595615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>