102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1262 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
180 aa  358  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.87 
 
 
177 aa  204  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.35 
 
 
173 aa  192  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.29 
 
 
173 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.65 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.42 
 
 
160 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.59 
 
 
172 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.23 
 
 
159 aa  174  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.89 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  56.77 
 
 
241 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.09 
 
 
160 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.14 
 
 
176 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 
160 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 
160 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  52.26 
 
 
161 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.21 
 
 
166 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  51.88 
 
 
173 aa  167  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.62 
 
 
162 aa  164  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.3 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.47 
 
 
171 aa  158  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.48 
 
 
184 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.48 
 
 
184 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  52.47 
 
 
164 aa  157  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.52 
 
 
178 aa  157  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  43.12 
 
 
162 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.02 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.51 
 
 
197 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.37 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.62 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.82 
 
 
285 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.44 
 
 
156 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  36.54 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.41 
 
 
219 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.27 
 
 
272 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.16 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.22 
 
 
247 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.56 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.48 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0052  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.66 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.47 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.01 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.66 
 
 
283 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.336826  normal  0.246739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.64 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.15 
 
 
249 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.84 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.84 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
307 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.94 
 
 
268 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2959  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.62 
 
 
168 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0294262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.82 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.64 
 
 
227 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.69 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.64 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.73 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.73 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  41.82 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3529  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.58 
 
 
264 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.1 
 
 
344 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.59 
 
 
464 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2279  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  41.38 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.13 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.55 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.5 
 
 
289 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
249 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.24 
 
 
192 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.82 
 
 
244 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.78 
 
 
349 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  40.48 
 
 
241 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.82 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  40.48 
 
 
241 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.9 
 
 
197 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
182 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.28 
 
 
268 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.9 
 
 
204 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.55 
 
 
244 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.48 
 
 
241 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.38 
 
 
249 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.75 
 
 
236 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  41.2  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.1 
 
 
295 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  45.45 
 
 
255 aa  41.2  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.03 
 
 
264 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4701  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.74 
 
 
255 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>