More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4115 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  70.45 
 
 
227 aa  263  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.61 
 
 
220 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.61 
 
 
238 aa  256  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  69.89 
 
 
244 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.75 
 
 
244 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  65.34 
 
 
238 aa  251  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.07 
 
 
268 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  67.05 
 
 
251 aa  247  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.93 
 
 
268 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.79 
 
 
247 aa  240  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.93 
 
 
249 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.14 
 
 
243 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  60.23 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3250  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.89 
 
 
256 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  59.09 
 
 
241 aa  225  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  59.09 
 
 
241 aa  225  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.66 
 
 
241 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.39 
 
 
206 aa  222  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.25 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.74 
 
 
224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  55.11 
 
 
206 aa  209  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  55.11 
 
 
206 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.41 
 
 
232 aa  204  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.18 
 
 
295 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.76 
 
 
227 aa  200  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0218873  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3987  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.17 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.37 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.49 
 
 
282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.09 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.89 
 
 
305 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.89 
 
 
305 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.89 
 
 
307 aa  194  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.44 
 
 
271 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.37 
 
 
282 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  48.6 
 
 
232 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.43 
 
 
225 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.44 
 
 
274 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.7 
 
 
264 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.8 
 
 
264 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.8 
 
 
264 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.37 
 
 
249 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.43 
 
 
236 aa  183  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.12 
 
 
223 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3409  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.3 
 
 
236 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.43 
 
 
286 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.22 
 
 
224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.54 
 
 
226 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.41 
 
 
217 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.43 
 
 
234 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.46 
 
 
229 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3877  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.16 
 
 
238 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2492  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.73 
 
 
237 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.325577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0324  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.16 
 
 
237 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.635256  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3587  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.16 
 
 
257 aa  175  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.61 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.55 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  46.29 
 
 
342 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.29 
 
 
342 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.13 
 
 
219 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.49 
 
 
316 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.9 
 
 
199 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.71 
 
 
344 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.5 
 
 
263 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.55 
 
 
257 aa  168  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.5 
 
 
255 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.5 
 
 
267 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.5 
 
 
225 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.5 
 
 
225 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4697  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.23 
 
 
224 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0835735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.21 
 
 
263 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.53 
 
 
262 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.51 
 
 
231 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.9 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.85 
 
 
283 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.7 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
259 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.29 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.31 
 
 
240 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.62 
 
 
224 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.28 
 
 
263 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.73 
 
 
210 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  52.2 
 
 
244 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  49.7 
 
 
313 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.71 
 
 
204 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3003  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.86 
 
 
241 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.25 
 
 
226 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.84 
 
 
259 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.23 
 
 
249 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0387  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.69 
 
 
194 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  51.9 
 
 
231 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.69 
 
 
230 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.71 
 
 
236 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436029  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.51 
 
 
253 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.333261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.38 
 
 
192 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2829  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.53 
 
 
419 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  48.48 
 
 
293 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0456  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 
249 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.35 
 
 
202 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.06 
 
 
228 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>