105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1589 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  77.46 
 
 		 173 aa  279  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  78.82 
 
 		 172 aa  278  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.83 
 
 		 179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.73 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.23 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  57.23 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  57.96 
 
 		 241 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.32 
 
 		 159 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.96 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.97 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.89 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  51.27 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  52.29 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  51.75 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  51.05 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.3 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.36 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.26 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.85 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.59 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.78 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.05 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.05 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.77 
 
 		 220 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.29 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.74 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 		 285 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.54 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.95 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.16 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  37.16 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.75 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.75 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.3 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.48 
 
 		 217 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.78 
 
 		 283 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.28 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 		 244 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 		 244 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.68 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.68 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.91 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.22 
 
 		 243 aa  44.3  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.303724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.92 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.3 
 
 		 349 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.46 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.96 
 
 		 464 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  27.62 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.46 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0695  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.62 
 
 		 356 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.8 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 206 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.51 
 
 		 199 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.53 
 
 		 206 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.46 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 187 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  51.52 
 
 		 251 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  41.46 
 
 		 238 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 206 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2959  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.1 
 
 		 168 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0294262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3529  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 199 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.96 
 
 		 217 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  45 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.51 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4381  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.51 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.53 
 
 		 249 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.59 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0523  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.82 
 
 		 260 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  34.92 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 311 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  40.82 
 
 		 293 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 307 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  36.84 
 
 		 311 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>