138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  78.82 
 
 
174 aa  278  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  77.65 
 
 
173 aa  277  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  75.44 
 
 
179 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  62.66 
 
 
160 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.61 
 
 
159 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.29 
 
 
166 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.15 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  58.49 
 
 
241 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.59 
 
 
180 aa  176  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  55.48 
 
 
161 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.33 
 
 
176 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.57 
 
 
162 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  54.09 
 
 
164 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.87 
 
 
159 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  51.28 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.94 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.94 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.41 
 
 
173 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.52 
 
 
177 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  48.25 
 
 
162 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.36 
 
 
171 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.3 
 
 
178 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  48.25 
 
 
162 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.06 
 
 
184 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.06 
 
 
184 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.35 
 
 
220 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.95 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.23 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.69 
 
 
285 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.14 
 
 
156 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.18 
 
 
181 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
156 aa  92  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  37.24 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.03 
 
 
219 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.17 
 
 
243 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.85 
 
 
272 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
236 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.22 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.33 
 
 
217 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.22 
 
 
283 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.3 
 
 
217 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  44.9 
 
 
251 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.24 
 
 
255 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.62 
 
 
267 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0695  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
356 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
349 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  38.98 
 
 
304 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.49 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.44 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.91 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
273 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.9 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0930  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
357 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.9 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.22 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3251  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
366 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.84 
 
 
332 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  29.73 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.34 
 
 
263 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1876  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  38.98 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.82 
 
 
268 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  41.86 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  45.45 
 
 
293 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.22 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3255  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
304 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000408528  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0523  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.9 
 
 
260 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457346  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.82 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  41.86 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.68 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.41 
 
 
358 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.46 
 
 
269 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 
258 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.46 
 
 
240 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.64 
 
 
204 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3748  LysM domain-containing protein  30.7 
 
 
304 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.86 
 
 
206 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0881  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
304 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000038242  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.53 
 
 
210 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>