266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1260 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.67 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.59 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.64 
 
 
156 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  46.45 
 
 
241 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  49.69 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  45.22 
 
 
161 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.68 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.77 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.17 
 
 
171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.02 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.95 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.94 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
285 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.74 
 
 
166 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  44.1 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.18 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.56 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.39 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  42.69 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.95 
 
 
172 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.45 
 
 
176 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.42 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.51 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.89 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
160 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
160 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.39 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.12 
 
 
181 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.42 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.42 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  36.13 
 
 
162 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  36.77 
 
 
162 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.94 
 
 
156 aa  99.4  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
160 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.75 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.23 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2880  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.21 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.28 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.97 
 
 
195 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3003  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.81 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.21 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357658  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.19 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.86 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.34 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.09 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.94 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.57 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.84 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.65 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.47 
 
 
269 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.65 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.3 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.12 
 
 
266 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.29 
 
 
232 aa  52  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.86 
 
 
217 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.79 
 
 
209 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.644821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.84 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60.98 
 
 
283 aa  51.6  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  30.91 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5998  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765606  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.28 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.54 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0060  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.38 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0210  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.75 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.521298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.16 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33235  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0331  hypothetical protein  27.67 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0961957  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.45 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  36.46 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1754  hypothetical protein  27.43 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.518871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  28.4 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.22 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.03 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  36.46 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6654  hypothetical protein  31.65 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  28.83 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  28.83 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.94 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2959  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 
168 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0294262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.43 
 
 
269 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.12 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  43.4 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.27 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>