215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1450 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
178 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  61.76 
 
 
173 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.65 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.32 
 
 
162 aa  187  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.99 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.32 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.47 
 
 
173 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.04 
 
 
179 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.12 
 
 
173 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.85 
 
 
174 aa  160  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.25 
 
 
177 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.3 
 
 
160 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.47 
 
 
159 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  157  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.22 
 
 
176 aa  157  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.52 
 
 
180 aa  157  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.3 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.25 
 
 
160 aa  154  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  54.68 
 
 
241 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  48.77 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.88 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.88 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  47.74 
 
 
162 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  55.2 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.37 
 
 
220 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.42 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.42 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.68 
 
 
156 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.86 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.42 
 
 
220 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.55 
 
 
156 aa  109  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.45 
 
 
285 aa  104  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
181 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  34.36 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.09 
 
 
272 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
273 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.08 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.54 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
277 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.76 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.27 
 
 
283 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.19 
 
 
249 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.62 
 
 
411 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.79 
 
 
247 aa  47.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  43.1 
 
 
304 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
266 aa  47.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.3 
 
 
221 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0448  hypothetical protein  40.68 
 
 
315 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  43.1 
 
 
306 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2688  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.29 
 
 
292 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00428161  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0717  hypothetical protein  32.52 
 
 
332 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.3 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.3 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.16 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
294 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.58 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2184  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295088  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2137  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.3 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0116  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
349 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2237  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.485694  normal  0.208005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.29 
 
 
132 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.28 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2350  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00214407  hitchhiker  0.00290758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  39.58 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3250  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.64 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2191  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.38 
 
 
310 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.38 
 
 
311 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  41.38 
 
 
307 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  41.38 
 
 
311 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.38 
 
 
358 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.3 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
249 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  41.38 
 
 
306 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.04 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0598  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.38 
 
 
306 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.38 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.12 
 
 
386 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>