63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2827 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2827  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1262  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.48 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1661  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.6 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  normal  0.670648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1326  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.3 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1685  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.65 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417261  normal  0.0902788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1874  hypothetical protein  51.88 
 
 		 241 aa  148  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2186  hypothetical protein  47.8 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2068  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.17 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.446397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1443  hypothetical protein  42.14 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1540  hypothetical protein  42.77 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1629  hypothetical protein  45.18 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14530  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.06 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1849  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.97 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0850  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.81 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1182  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.81 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2508  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.56 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.17 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1937  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.06 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1862  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.67 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.377434  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1226  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.28 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.1 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0244423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.42 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000594458  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.1 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  46.25 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1327  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.22 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 		 156 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.48465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3471  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.35 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0601  hypothetical protein  41.67 
 
 		 269 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1765  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 285 aa  90.1  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.46 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1430  hypothetical protein  51.22 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 314 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 314 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1553  hypothetical protein  48.78 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.71 
 
 		 441 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0660  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.99 
 
 		 260 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal  0.201903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  44.68 
 
 		 435 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.22 
 
 		 409 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.91 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1507  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  hitchhiker  0.0000000116933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1488  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000455538  hitchhiker  0.000000000000619269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1796  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1967  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00349723  hitchhiker  0.0000000102388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000218095  normal  0.0466292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.22 
 
 		 409 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.49 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.06 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 		 439 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4451  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2622  peptidoglycan-binding LysM:ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein  40.35 
 
 		 322 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0580662  normal  0.781551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.9 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1754  hypothetical protein  27.91 
 
 		 269 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.518871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.23 
 
 		 240 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 361 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.840952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>