More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0564 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  490  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  92.02 
 
 
238 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.45 
 
 
244 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.29 
 
 
244 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.61 
 
 
247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  58.12 
 
 
251 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.33 
 
 
227 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.44 
 
 
243 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.59 
 
 
220 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.97 
 
 
268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  52.5 
 
 
241 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  52.5 
 
 
241 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.32 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.39 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.34 
 
 
184 aa  252  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.84 
 
 
268 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  61.02 
 
 
254 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.45 
 
 
206 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.32 
 
 
206 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  58.29 
 
 
206 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  55.91 
 
 
206 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.51 
 
 
224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3250  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.51 
 
 
256 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.77 
 
 
227 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0218873  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3987  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.76 
 
 
227 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  53.93 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.39 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.58 
 
 
232 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
295 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.22 
 
 
282 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.81 
 
 
267 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.87 
 
 
258 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.04 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.8 
 
 
264 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.33 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.4 
 
 
282 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.69 
 
 
264 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.57 
 
 
344 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.69 
 
 
305 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.69 
 
 
305 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.49 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  50 
 
 
342 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52 
 
 
226 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.69 
 
 
307 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
342 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.58 
 
 
224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.43 
 
 
223 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4697  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.45 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0835735  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
193 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.86 
 
 
286 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.83 
 
 
195 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
236 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.46 
 
 
224 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0324  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
237 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.635256  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2492  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.68 
 
 
237 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.325577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.34 
 
 
274 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.31 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.73 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3409  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.98 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.32 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.36 
 
 
316 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.57 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  49.72 
 
 
293 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.24 
 
 
240 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0523  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.72 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457346  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.87 
 
 
267 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3877  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.57 
 
 
238 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.87 
 
 
234 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289456  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3587  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.57 
 
 
257 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.73 
 
 
262 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
219 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.95 
 
 
229 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2497  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.75 
 
 
267 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.12 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.27 
 
 
263 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.27 
 
 
263 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.27 
 
 
259 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.11 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  48.89 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0660  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.02 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal  0.201903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.5 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.57 
 
 
204 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.32 
 
 
269 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  50.31 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.62 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.57 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
283 aa  161  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1754  hypothetical protein  43.75 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.518871  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  49.69 
 
 
313 aa  161  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5602  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41 
 
 
215 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31169  normal  0.82128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5810  hypothetical protein  50.9 
 
 
266 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.63 
 
 
215 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
266 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.96 
 
 
248 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.15 
 
 
192 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.47 
 
 
226 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
210 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.7 
 
 
200 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.6 
 
 
269 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>