More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4263 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3587  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  83.47 
 
 
257 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3877  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  81.51 
 
 
238 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3409  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  78.81 
 
 
236 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  79.66 
 
 
234 aa  387  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289456  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0324  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  73 
 
 
237 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.635256  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2492  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  73 
 
 
237 aa  363  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.325577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.55 
 
 
264 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.16 
 
 
267 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.57 
 
 
264 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.31 
 
 
258 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.64 
 
 
249 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.83 
 
 
244 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.43 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.13 
 
 
204 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.7 
 
 
247 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.65 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3250  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.38 
 
 
256 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.67 
 
 
206 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.6 
 
 
227 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
282 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  41.81 
 
 
251 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.59 
 
 
244 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.9 
 
 
224 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.47 
 
 
217 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48 
 
 
206 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.12 
 
 
226 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.6 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.75 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.6 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.13 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.15 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.07 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.13 
 
 
238 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.32 
 
 
286 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.98 
 
 
282 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.51 
 
 
307 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  48.57 
 
 
206 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.81 
 
 
223 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.08 
 
 
295 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.2 
 
 
316 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.1 
 
 
225 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.46 
 
 
232 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.65 
 
 
274 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.36 
 
 
199 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  48 
 
 
206 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.56 
 
 
214 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.37 
 
 
268 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 
228 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.66 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.28 
 
 
344 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.37 
 
 
219 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.3 
 
 
193 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.76 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.77 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  46.39 
 
 
342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.76 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.39 
 
 
342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.11 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.23 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  46.02 
 
 
232 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.12 
 
 
231 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.02 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.167161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.16 
 
 
224 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.57 
 
 
226 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3987  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.71 
 
 
227 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  40.68 
 
 
254 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.65 
 
 
227 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0218873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  50.67 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.34 
 
 
210 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2129  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.71 
 
 
408 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838619  normal  0.0574467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.55 
 
 
241 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.5 
 
 
354 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.098708  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  47.13 
 
 
313 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  37.61 
 
 
241 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  37.61 
 
 
241 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  46.5 
 
 
244 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3003  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.12 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.01 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.53 
 
 
283 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.79 
 
 
263 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.01 
 
 
265 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.61 
 
 
410 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.1 
 
 
259 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.46 
 
 
259 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.8 
 
 
239 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239202  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.85 
 
 
255 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4131  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.86 
 
 
421 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.2 
 
 
406 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.453265  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45 
 
 
199 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.3 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436029  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6995  hypothetical protein  39.64 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.67 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.333261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  42.77 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.28 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1965  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.33 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>