More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0302 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  99.67 
 
 
305 aa  621  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  92.51 
 
 
307 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.65 
 
 
316 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.02 
 
 
274 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.22 
 
 
271 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.5 
 
 
258 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.19 
 
 
249 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  47.98 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.87 
 
 
282 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.84 
 
 
295 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.89 
 
 
282 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.65 
 
 
226 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.76 
 
 
247 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.24 
 
 
217 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.1 
 
 
268 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  51.65 
 
 
206 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.19 
 
 
249 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.1 
 
 
206 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  51.65 
 
 
206 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.37 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.94 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0218873  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.01 
 
 
227 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.4 
 
 
220 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3987  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.01 
 
 
227 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.25 
 
 
243 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.89 
 
 
184 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.1 
 
 
206 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.97 
 
 
264 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.78 
 
 
238 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.48 
 
 
264 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.57 
 
 
224 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.01 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.95 
 
 
268 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.93 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.04 
 
 
344 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  52.97 
 
 
232 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.69 
 
 
229 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.97 
 
 
224 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  53.37 
 
 
241 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  47.69 
 
 
238 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  53.37 
 
 
241 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  51.04 
 
 
342 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.76 
 
 
263 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.04 
 
 
342 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.96 
 
 
204 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.72 
 
 
244 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.46 
 
 
240 aa  185  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.22 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.84 
 
 
204 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.14 
 
 
263 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.44 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.08 
 
 
267 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.52 
 
 
259 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.26 
 
 
266 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.76 
 
 
192 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.03 
 
 
225 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.88 
 
 
262 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.22 
 
 
263 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.02 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.02 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.98 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3003  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.16 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.99 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.22 
 
 
283 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  45.41 
 
 
251 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.45 
 
 
264 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2880  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.71 
 
 
240 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6254  hypothetical protein  58.06 
 
 
405 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.71 
 
 
240 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357658  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.15 
 
 
267 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.03 
 
 
257 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.76 
 
 
265 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.28 
 
 
219 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.85 
 
 
255 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.02 
 
 
231 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  54.04 
 
 
237 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  54.04 
 
 
255 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  56.13 
 
 
231 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.04 
 
 
230 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.6 
 
 
269 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.05 
 
 
227 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  52.66 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  53.7 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.27 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3250  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.44 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.71 
 
 
226 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.6 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
212 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5602  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.03 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31169  normal  0.82128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3409  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.25 
 
 
236 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.08 
 
 
246 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.76 
 
 
210 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  52.53 
 
 
223 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
160 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.37 
 
 
354 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.098708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.14 
 
 
221 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.94 
 
 
187 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2497  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.62 
 
 
267 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>