22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03976 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  38.27 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  43.09 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  28.93 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  29.85 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  47.22 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  31.47 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  31.31 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1559  hypothetical protein  28.96 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00684601  unclonable  0.00000000000182676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  29.17 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  25.4 
 
 		 249 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  27.61 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  27.21 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2039  hypothetical protein  31.9 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05722  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000113  hypothetical protein  25.52 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0724  hypothetical protein  26.84 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.887618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003752  hypothetical protein  30.36 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>