14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0144 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  62.96 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  53.11 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1220  hypothetical protein  49.47 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1128  hypothetical protein  47.75 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.00000000000294769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0580  hypothetical protein  32.64 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  35.07 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04400  hypothetical protein  28.73 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  31.16 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  32.93 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  31.47 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  30.06 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  27.23 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>