14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0546 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  69.84 
 
 		 188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  30.37 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  28.5 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  31.03 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  27.78 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  32.17 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  27.04 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1220  hypothetical protein  29.59 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  26.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1128  hypothetical protein  30.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.00000000000294769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  33.78 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>