14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03968 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  59.24 
 
 
190 aa  224  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1220  hypothetical protein  47.94 
 
 
190 aa  190  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  52.81 
 
 
191 aa  187  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1128  hypothetical protein  45.95 
 
 
190 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.00000000000294769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04400  hypothetical protein  27.75 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0580  hypothetical protein  27.42 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  30.43 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  27.59 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  26.87 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  28.87 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  25.4 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  23.81 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  25.71 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>