15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03114 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  39.69 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  40.11 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  60.4 
 
 		 101 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  38.55 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  38.31 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  27.64 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  26.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1559  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00684601  unclonable  0.00000000000182676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  24.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  26.47 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0724  hypothetical protein  26.34 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.887618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2039  hypothetical protein  27.5 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>