14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0544 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  69.84 
 
 
188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  31.41 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  31.95 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  27.84 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  28.42 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  27.64 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1220  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1128  hypothetical protein  30.68 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.00000000000294769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  26.96 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  29.9 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  34.25 
 
 
101 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>