16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0386 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0386  porin family outer membrane protein  100 
 
 		 186 aa  364  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0493197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03114  Outer membrane protein, porin family  41.24 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  43.53 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2819  porin family outer membrane protein  37.7 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.504294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1588  hypothetical protein  37.37 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.444233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  44.55 
 
 		 101 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0544  hypothetical protein  31.41 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.178626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0546  hypothetical protein  28.5 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0144  hypothetical protein  37.61 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0271  hypothetical protein  29.38 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192326  normal  0.62997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1559  hypothetical protein  27.89 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00684601  unclonable  0.00000000000182676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1809  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03968  hypothetical protein  28 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0580  hypothetical protein  32.28 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05722  hypothetical protein  25.58 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1220  hypothetical protein  25.83 
 
 		 190 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>