11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3430 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  67.19 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  64.03 
 
 		 250 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  56.13 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0255  hypothetical protein  41.75 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0197  hypothetical protein  41.99 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.331771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0197  hypothetical protein  41.99 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3955  hypothetical protein  31.27 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3587  hypothetical protein  35.35 
 
 		 317 aa  148  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0298  hypothetical protein  31.19 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  28.57 
 
 		 184 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>