13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0795 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  70.92 
 
 
251 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  66.4 
 
 
249 aa  332  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  64.03 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0197  hypothetical protein  45.49 
 
 
277 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.331771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0197  hypothetical protein  45.49 
 
 
277 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0255  hypothetical protein  41.22 
 
 
296 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3955  hypothetical protein  32.84 
 
 
338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3587  hypothetical protein  37.76 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0298  hypothetical protein  33.86 
 
 
321 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  27.61 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03268  hypothetical protein  27.17 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3950  putative porin  25.24 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>