13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2714 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  70.92 
 
 		 250 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  67.19 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  59.04 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0197  hypothetical protein  47.31 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.331771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0197  hypothetical protein  47.31 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0255  hypothetical protein  42.23 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3955  hypothetical protein  34.12 
 
 		 338 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3587  hypothetical protein  36.95 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0298  hypothetical protein  33.54 
 
 		 321 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  27.21 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03268  hypothetical protein  25.39 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3950  putative porin  24.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>