12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3123 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  66.4 
 
 		 250 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  59.04 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  56.13 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0255  hypothetical protein  36.73 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0197  hypothetical protein  38.27 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.331771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0197  hypothetical protein  38.27 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3955  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3587  hypothetical protein  35.05 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0298  hypothetical protein  31.97 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  25.4 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03268  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>