More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1640 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1640  ABC-type maltose transport system, permease component  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000193364  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.58 
 
 
272 aa  288  9e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 
701 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  42.27 
 
 
701 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
722 aa  185  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
270 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
406 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
273 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
268 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0183721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
743 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
280 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
297 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
275 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
272 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.31 
 
 
277 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
198 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.766568  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
284 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
270 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
277 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
279 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  32.97 
 
 
273 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
299 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
299 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.75 
 
 
291 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  28.41 
 
 
308 aa  159  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
279 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
274 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.34 
 
 
297 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
297 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.81 
 
 
295 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
286 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
301 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 
295 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
290 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
291 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
271 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  31.94 
 
 
280 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  34.48 
 
 
315 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
294 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
301 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
270 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  31.2 
 
 
272 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
294 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
272 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 
269 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
285 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  29.37 
 
 
286 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.06 
 
 
298 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
303 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29 
 
 
305 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 
290 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
295 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  27.04 
 
 
278 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.31 
 
 
296 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.71 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
296 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 
273 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 
273 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  29.52 
 
 
273 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
275 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
295 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.08 
 
 
304 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
300 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
302 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
293 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
304 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
299 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
273 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
283 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
299 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.03 
 
 
302 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
294 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  30 
 
 
276 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  28.24 
 
 
277 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
276 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
279 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
273 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0449998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
273 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  31.85 
 
 
281 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.78 
 
 
273 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 
275 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>