More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1864 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1864  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.92 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0408643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
273 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
271 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.25 
 
 
269 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.65 
 
 
270 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
267 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.16 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.25 
 
 
270 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.98 
 
 
272 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.02 
 
 
276 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
266 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.32 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.97 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.98 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.98 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.43 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
301 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.4 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 
277 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
256 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.41 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.23 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.02 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  30.83 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.77 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.99 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.62 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  29.92 
 
 
289 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
272 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
269 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.97 
 
 
281 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
273 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.4 
 
 
274 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 
266 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.97 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.43 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.27 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.27 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
268 aa  111  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
289 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.9 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.65 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  31.18 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.33 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
277 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
273 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
263 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.29 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.02 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.35 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.73 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.27 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl045  1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
266 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.39 
 
 
273 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.46 
 
 
272 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.91 
 
 
270 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
285 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.52 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.52 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.91 
 
 
286 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.1 
 
 
277 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
269 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
270 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
274 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
271 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.8 
 
 
271 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
263 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.8 
 
 
272 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
280 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
271 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
273 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
272 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.71 
 
 
265 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
273 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
272 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.2 
 
 
264 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.11 
 
 
279 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.69 
 
 
271 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 
263 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.52 
 
 
271 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
276 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.91 
 
 
274 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
276 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.17 
 
 
270 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>