29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  44 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  39.62 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  37.89 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  41.49 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  31.82 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  37.89 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  34.03 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.18 
 
 		 478 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  34.48 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  33.05 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  36 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  35.59 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  36.26 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  37.96 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0535  hypothetical protein  35.56 
 
 		 402 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 520 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 		 526 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  33.98 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.89 
 
 		 506 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4198  pyruvate carboxylase  27.85 
 
 		 1148 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.721945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.97 
 
 		 734 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  35.96 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1816  pyruvate carboxylase  31.48 
 
 		 1129 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.43 
 
 		 522 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.35 
 
 		 505 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  33.04 
 
 		 221 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>