23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1477 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  84.62 
 
 		 169 aa  296  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4535  hypothetical protein  36.21 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.551299  normal  0.636463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  31.76 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  35.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  31.71 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  35.09 
 
 		 234 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  30.61 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 264 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  30.93 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  32.73 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.96 
 
 		 734 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  34.04 
 
 		 230 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  23.03 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  26.72 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  26.72 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  26.72 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  31.96 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 		 618 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.46 
 
 		 521 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>