20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0234 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  36.32 
 
 
227 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  37.76 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  30.46 
 
 
220 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  27.67 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  28.85 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  32.63 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  35.64 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  28.07 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  27.65 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.5 
 
 
625 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  34.04 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  28.98 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  36.67 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  36.56 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  32.41 
 
 
221 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>