29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3149 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  42.92 
 
 
227 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  37.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  37.78 
 
 
220 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  43.2 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  40.62 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  26.67 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.2 
 
 
478 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  32.45 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.65 
 
 
516 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  37.72 
 
 
481 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  35.09 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.55 
 
 
491 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  38.46 
 
 
734 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  31.05 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 
545 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.93 
 
 
717 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  35.16 
 
 
169 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.05 
 
 
625 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.14 
 
 
468 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.83 
 
 
520 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.28 
 
 
521 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.78 
 
 
549 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  30.56 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  25.93 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>