36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0468 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  37.37 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  47.62 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  47 
 
 		 717 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.53 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.95 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  31.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  30.46 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  34.66 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  34.86 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  30.59 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.61 
 
 		 516 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.36 
 
 		 520 aa  48.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33.98 
 
 		 505 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.22 
 
 		 549 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  38.71 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.83 
 
 		 520 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 521 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4535  hypothetical protein  25.48 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.551299  normal  0.636463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.14 
 
 		 734 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  33.56 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.22 
 
 		 509 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0098  hypothetical protein  41.25 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.51 
 
 		 526 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  42.59 
 
 		 512 aa  42  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.74 
 
 		 643 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 701 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 699 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 699 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0535  hypothetical protein  30.34 
 
 		 402 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  33.12 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  46.15 
 
 		 530 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 504 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  32.61 
 
 		 481 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>