29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26330 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  43.2 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  37.57 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  31.64 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  30.25 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  30.69 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  35.65 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  37.39 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  32.57 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4535  hypothetical protein  29.01 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.551299  normal  0.636463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.3 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  41.49 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  28.42 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  45.26 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  27.18 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.36 
 
 		 734 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  36.63 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.26 
 
 		 468 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.02 
 
 		 516 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  30.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.66 
 
 		 717 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  40.78 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  31.5 
 
 		 505 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.64 
 
 		 520 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.04 
 
 		 545 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.59 
 
 		 509 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  32.04 
 
 		 481 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  31.87 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.68 
 
 		 465 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>