33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1867 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  100 
 
 		 179 aa  350  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  31.15 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  32.6 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  37.61 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  35.51 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  32.93 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  37.25 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  31.72 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  36.63 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  36.94 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  29.88 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  33.12 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.46 
 
 		 717 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.37 
 
 		 497 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  35.11 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  34.65 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.78 
 
 		 734 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.48 
 
 		 468 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  29.73 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  27.66 
 
 		 505 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 491 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 		 551 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.78 
 
 		 526 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.78 
 
 		 478 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  38 
 
 		 521 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  26.52 
 
 		 209 aa  41.6  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  26.06 
 
 		 234 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>