18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3936 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  86.88 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  72.48 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  72.48 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  72.48 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  65.6 
 
 
216 aa  255  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  41.7 
 
 
234 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  40.09 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  39.73 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  42.54 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  39.33 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  42.27 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  36.52 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  29.51 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  26.4 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  36.44 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  38.89 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  25.29 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>