27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  37.99 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  45.45 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  39.47 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  36.68 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  32.62 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  37.39 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  37.11 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  32.26 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  38.18 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  29.92 
 
 		 734 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  30.93 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  34.75 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  33.05 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.97 
 
 		 526 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  35.78 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  33.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4535  hypothetical protein  31.76 
 
 		 172 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.551299  normal  0.636463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.48 
 
 		 687 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  31.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  31.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  31.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  35.24 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  31.97 
 
 		 234 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.14 
 
 		 717 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>