16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0533 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  39.36 
 
 
234 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  36.22 
 
 
227 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  31.71 
 
 
230 aa  99  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  36.26 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  29.47 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  32.64 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  32.08 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  29.17 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  30.95 
 
 
169 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  27.78 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.65 
 
 
717 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4535  hypothetical protein  24.58 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.551299  normal  0.636463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  36.67 
 
 
734 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>