19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0399 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  40.51 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  34.85 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  42.25 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  35.96 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  35.65 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  30.73 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  30.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  33.67 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  30.61 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  32.99 
 
 		 264 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  29.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  36.56 
 
 		 734 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  34.65 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  32.29 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.44 
 
 		 526 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  32.26 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.98 
 
 		 545 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.9 
 
 		 516 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>