23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0061 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  48.04 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  32.62 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  29.66 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0399  hypothetical protein  31.37 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  28.85 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  31.82 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.89 
 
 		 687 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0565  hypothetical protein  31.91 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34530  hypothetical protein  35.37 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0533  hypothetical protein  28.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.521375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.46 
 
 		 649 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  27.83 
 
 		 734 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3149  hypothetical protein  31.63 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471503  hitchhiker  0.00441902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 717 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0468  hypothetical protein  29.31 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 465 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  31.96 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1442  hypothetical protein  31.96 
 
 		 169 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 522 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>