24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34530  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0429  hypothetical protein  39.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0881572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0098  hypothetical protein  34.4 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10436  tuberculin-like peptide  40 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3990  hypothetical protein  45 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0571  putative tuberculin related peptide  40 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0583  putative tuberculin related peptide  40 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568486  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0561  putative tuberculin related peptide  40 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0777  hypothetical protein  34.38 
 
 		 416 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0815  hypothetical protein  30.84 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0180  hypothetical protein  36.96 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323163  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0061  hypothetical protein  35.37 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0891  hypothetical protein  30.17 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.06 
 
 		 625 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  31.36 
 
 		 684 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2264  hypothetical protein  36.08 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.98 
 
 		 522 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.67 
 
 		 520 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0173  putative tuberculin related peptide  34.12 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.07 
 
 		 545 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4393  hypothetical protein  34.07 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0734  putative tuberculin related peptide  35.29 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  37.7 
 
 		 530 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>