16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  39.39 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  38.69 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  41.8 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  37.27 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  42.02 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  42.02 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  42.02 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  37.31 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  37.6 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  34.19 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  35.64 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  40.78 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  37.76 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  31.45 
 
 		 264 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>