16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3762 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  40.29 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  41.51 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  41.8 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  42.54 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  41.48 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  41.48 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  41.79 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  45.39 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  40.54 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  37.9 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25980  hypothetical protein  39.62 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  35.11 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0702  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.23 
 
 		 625 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>